新時代的海巡署任務將更趨多元化，為使國人對海巡業務有整體深入的了解，完整展現豐碩施政成果，2011海巡報告書共分4篇介紹海巡任務：
一、「海巡風雲錄」：蒐整本署2010年重大施政成果，選出具指標意義重大事紀，呈現本署多元工作成效。
二、「任務與挑戰」：以本署2010年海域執法、海事服務與海洋事務三大核心任務為主軸、說明各項工作之目標、年度執行狀況及未來策進作為。
三、「建設與服務」：針對本署2010年海巡建設、海巡人力與海巡服務等工作面向，敘明巡防艦艇籌建狀況、廳舍碼頭規劃進展、人力資源經營培育
　　　　　　　　　　及為民服務精進作為。
四、「創新與展望」：肆應政府組織變革、海域執法環境變遷及國際海洋發展趨勢，就本署組織改造、兩岸搜救演練、簡併安檢單位及強化遠距能量
　　　　　　　　　　等面向，探討海巡業務轉型的新挑戰及共同努力的新方向。

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