傳統的診斷方法
藏醫在診斷疾病時講究使用問診、望診和觸診三種方法，這與中醫所採用的望、聞、問、切四診法有類似之處，但藏醫問診的內容十分廣泛詳細，有關脈診的經驗也極為豐富，而望診中的尿診更是藏醫所獨有的、享譽世界的特色診斷方法。
1. 問診
問診即詢問病人與病情有關的情況，所問的內容相當廣泛，概括起來包括：
起病緩急：如果是突然起病則大多是急症，如感冒多會突然引發惡寒、發熱、頭痛；而五臟六腑疾病則多為慢性病，在不知不覺間發生。
起病原因：有些病症患者自己可以明確指出原因或誘因，如由於暴飲暴食而發生胃痛、嘔吐、腹瀉等，因此診斷時應詳細問明。
居住環境：居住環境的冷熱、濕度以及通風情況等，都是引發疾病的重要因素，這一點不能忽略。
飲食起居：飲食失當將會導致胃腸病、瘟病、氣息不安、呃逆、食積痞瘤等多種疾病。在問診過程中不可忽視。
職業、家庭：有些疾病與患者的職業有關，如強體力勞動者易患擴散傷熱；有的疾病與患者家庭有關，如有些瘟疫病會在家庭成員中互相傳染。
此外，問診內容還應包括發病後病情的變化以及已經接受過的治療等等，總之，詢問的內容越詳細，對於診斷就越有利。
2. 觸診
所謂觸診主要是切脈。藏醫認為脈搏就像是為醫生報告病情的使者，藉著切脈可以非常準確地掌握患者的病情。脈診在方法和技巧方面都十分有講究，包括脈診前的準備、診斷的時間、切脈的技巧、脈象的辨別，以及脈象與臟腑、季節、五行的關係等。
進行脈診的前一天，為了使結果準確無誤，患者應避免進食酒肉或性溫有營養難消化的飲食，以及性涼影響病情的飲食，要避免過饑或過飽、房事、貪睡、話多、勞神等。診脈的時間最好選擇在清晨朝陽初露的時候，因為此時天氣陰陽均衡、寒熱調和，人體尚未開始活動，受情緒及體力活動的影響最小。診脈前，患者不能進飲食，而應安坐在床上，保持平靜不動，呼吸均勻，使臟腑陰陽平衡，並使手上之脈安於脈道，這樣才可以進行診斷。
脈診的部位有寸、甘、恰，其中寸位於腕部橫紋向心一寸的地方，骨頭突起的內側，診脈時用食指、中指、無名指三個指頭平放，依次按診寸、甘、恰三個部位。手法有輕按、中按、重按之分，候寸脈時應輕按於皮膚之上，候甘脈時應中按至肌肉處，候恰脈時則須重按到深處著骨為止。當病人即將死亡，脈象不顯時，可以切足背部的趺陽脈來診斷。
切脈時，患者須將手放鬆自如，男人診左手脈，女人診右手脈，同時還要診切患者另一隻手的脈作為參考。正常情況下人有三種脈象：陰脈、陽脈、中性脈。陽脈的脈勢粗壯而搏動緩慢，陰脈的脈象細而搏動迅速，中性脈的脈象流長而光滑，柔和而不疾驟。一般來說，男子多為陽脈，女子多為陰脈，但也有女子而具陽脈，男性而具陰脈的情況，中性脈則男女皆見。醫生在診脈之初，必須首先對患者素質的平脈是屬陽、屬陰或為中性作出判斷。
病態脈象大致有浮、沈、洪、弦、大、小、滑、澀、滿、實、虛、遲、數、長、短、緩、緊、弱、粗、硬、柔、促、扁、間歇、慢等二十多種情況。其中熱性病的脈象為數、洪、浮、緊、滑、實，寒性病的脈象為沈、遲、弱、細、微、虛，診斷時一定要準確區分，以免發生誤診。
此外，藏醫還根據人與自然界生物和諧共生的思想，提出了脈象與季節和五行的關係。春、夏、秋、冬四季可以分為五個時際。一、二、三月為春季，騎士、翼宿、參宿當值，此時是植物發芽、百靈鳥鳴叫的時節，七十二天屬木，主肝脈，其脈象猶如百靈鳥的鳴叫聲，細而緊，其餘十八天屬土，主脾脈。四、五、六三個月為夏季，氐宿、箕宿當值，此時是花葉繁茂、杜鵑鳥鳴叫的時節，七十二天屬火，主心脈，其脈象猶如杜鵑鳥的鳴叫聲，洪而長，其餘十八天屬土，主脾脈。七、八、九三個月為秋季，牛宿、室宿、婁宿當值，此時是植物果實成熟、鷂鷹振舞翅膀的時節，七十二天屬金，主肺脈，其脈象猶如雕鷹的鳴叫聲，短而澀，其餘十八天屬土，主脾脈。十、十一、十二月為冬季，昴宿、咀宿、三星當值，此時是大地結凍、青鹿鳴叫的時節，七十二天屬水，主腎脈，其脈象猶如鷗鳥的鳴叫聲，滑而遲，其餘十八天屬土，主脾脈。以夏至冬至為中軸，四季平分，每季中各有十八天，總共是七十二天屬土，主脾脈，其脈象猶如麻雀的鳴叫聲，短而緩。以上是四季脈與五行的推算法。
這樣，根據五行的相生相剋關係，就可以診斷臟腑之間相互聯繫、相互影響的狀況。木、火、土、金、水五者，是五行相生的關係，火、水、土、木、金五者，是五行相剋的關係；同樣，五臟肝、心、脾、肺、腎為相生關係；心、腎、脾、肝、肺為相剋關係。春季五行屬木，臟為肝，肝之母為腎水。也就是說這個季節的本脈為肝脈，如肝脈細而跳動緊，是本脈旺盛之正常徵象。其母脈為腎脈，如腎脈表現為柔和而遲緩，證明母脈正常。其友脈為脾脈，如脾脈旺盛則肝得所養。其子脈為心脈，如子脈平和則肝木相安。其敵脈為肺脈，如肺脈亢盛，則將出現危殆之症。各季臟腑的狀況都可以依法類推。母脈與本脈脈象盛為最佳，相生脈出現友脈和子脈便會有福德，相剋脈出現敵脈，或者疾病比較難治療的，將會有死亡的危險。
此外，《四部醫典》中還記載了幾種奇特的脈象，如妊娠脈、反常脈、不全脈、間歇脈等。妊娠脈的脈象高突而滑利，右部腎脈搏動強烈生男，左部腎脈搏動強烈則生女。反常脈被視為不祥的預兆，如體力強壯的人患有突發性疾病，反呈細弱脈象；病期久長，二精受損的人，反呈浮洪脈象；寒症出現熱症脈象，熱症出現寒病脈象等。不全脈是指寸、甘、恰三部脈象如有一部不顯明，則是五臟之脈不全，可能轉成危症或死症。健康脈與病脈的區別，還在於脈搏的次數。健康的脈搏一般是在一呼一吸間脈跳五次，這樣的跳動在一百次以內沒有大小、沈浮、急緩、間歇、張弛等差異，均勻地跳動，叫作平脈，與此相反便是病脈。在一呼一吸間脈跳超過五次的是熱性疾病，少於五次的是寒性疾病。健康的脈搏在指下應如連成串的念珠一樣，否則脈跳就會呈現出混亂和停滯。脈來數至，驟然中止，稍停片刻後又恢復搏動，這種有規律的或者無規律的休止和停頓，就被稱為間歇脈。
總之，脈診主要被用來診斷臟器疾病，並且可以定奪生死。
3. 望診
從廣義上說，望診包括對於所有肉眼能夠看到的徵候的觀察，包括病人的神色、體型、皮膚顏色、大便、小便、痰等。狹義上來講，望診主要包括舌診和尿診。舌診主要是觀察病人的舌質和舌苔。正常人的舌是紅潤而且靈活的，而隆病病人的舌質紅，舌苔乾而粗糙；赤巴病病人的舌苔黃而厚；培根病病人的舌苔白而濕滑。尿診是藉著觀察病人尿的顏色、氣泡、沈澱物等情況來診斷疾病的方法，也是藏醫最具特色的診斷方法。一位醫術高超、經驗豐富的藏醫在不看到病人的情況下，就可以藉著察尿來準確地判斷出疾病。
關於尿診的方法和技巧，主要包括尿診前的準備、尿液變化的原理以及各種尿液的辨別等。
患者在接受尿診的前一天，不宜喝茶、清奶、青稞酒等飲料，也不宜過量飲水、過度勞累，要避免行房事，以免造成代謝紊亂，影響診斷結果。採集尿樣時，應將前半夜的尿倒掉不用，而將清晨起床後第一次排出的尿液作為診斷的標本。這是因為人體內的消化步驟到半夜才能全部完成，所以子夜以後的尿液最能代表人的真實健康情況。察尿應該在早晨太陽剛出來的時候進行，這樣可以更好地觀察尿液的顏色、蒸汽、沈澱物等情況。盛放尿液的容器最好是瓷碗、青銅盆或白色的鐵皮容器，也可以用白色的陶器代替，其他顏色的容器則不適宜。
藏醫認為，飲食在胃中清、濁分離後，糟粕進入腸道，分為稠、稀兩種，稀的進入膀胱，形成尿液，精華藉著肝變為血液，血液的糟粕積存於膽，膽的精華變為身體內的黃水，糟粕藉著脈道進入膀胱，變為尿液中的沈澱物。所以，尿液本身的顏色來自飲食，沈澱物則是由血和膽中產生的，身體的寒熱都可以藉著尿檢來進行鑑別。這就是藏醫尿診的原理。
具體來說，健康人的尿液呈清亮的淡黃色，聞上去有騷味，熱氣均勻，泡沫一致，沈澱物少而均勻分佈，蒸汽消失後，尿液從邊緣流漩。而染患疾病以後，人的尿液會發生明顯的變化。驗尿時可分熱、溫、涼三個階段對尿液進行鑑別：
1.初查熱尿：這一階段主要是觀察尿液的顏色、蒸汽、氣味、泡沫等。
從顏色來看，隆病病人的尿液是清稀的微藍色；赤巴病病人的尿液呈黃色；培根病病人的尿液呈白色；血病病人的尿液呈紅色；黃水症病人的尿液呈灰白色；紫症病人的尿液呈紫色；傳經紊亂症病人的尿液呈紅黃色，濃度高，且有臭味；黑色或帶彩虹色的尿液顯示的是中毒症。從蒸汽來看，尿液蒸汽大的是熱症；小而時間長久的是隱伏熱症或陳舊熱症；小而時間短的是培根、隆型的寒性疾病；蒸汽不穩定而忽大忽小的是寒熱混合症。從氣味來看，尿液臭味大的是熱性疾病，無臭味或臭味小的是寒性疾病，散發出食物氣味的，則反映出該食物消化不良。從泡沫來看，尿液泡沫大而微藍的是隆病，小而發紅黃色的是赤巴病，泡沫像口涎的是培根病，像彩虹的是中毒症，泡沫呈紅色的是血病，好像鷂子捕捉鴿子一樣的是擴散症。
2.次觀溫尿：這一階段主要是觀察尿液中的沈澱物和漂浮物。
沈澱物像山羊毛形狀的是隆病，像綿羊毛一樣一團團的是赤巴病或血病，像毫毛的是培根型寒性病，像空中的白雲一樣的是肺病，沈澱物呈膿狀的表明體內有膿液，如粒粒沙子一樣的是腎臟疾病。漂浮物像乳酪一樣漂浮在尿液表面的，是隆攪亂了身體的寒熱；漂浮物靜置後產生自然龜裂的是痞塊症。總之，漂浮物厚的是熱病；漂浮物薄的是寒病。
3.再看涼尿：這一階段主要是觀察尿液起變化的時間、變化的情況、攪後回漩的情況。
如果尿液在蒸汽未消失之前就發生變化，則是熱病；尿液已經變涼、蒸汽已經消失之後發生變化，則是寒病。尿液的蒸汽消失與尿液變化同時出現者，寒熱均勻。攪動後，尿液無厚薄之分，而從其邊緣開始發生變化的是寒病；從中心開始發生變化的是熱病初期；從尿液的邊緣很快發生變化的是陳久性熱病；沈澱物先起變化的是寒熱相鬥症。熱症潰散、寒症蔓延和鬼魔作祟等三種疾病的尿液皆無變化，須從尿液回漩後的情況來查看病因，尿液稠的是熱性疾病，稀的則是寒性疾病。
總之，各種病態尿液可以分為熱性和寒性兩種。熱性尿液的顏色呈紅黃色，濃度高，氣味臭，蒸汽大且持續時間長，泡沫小而易消失，浮膜厚，沈澱物呈絮狀聚集在尿液的中心，蒸汽未消失前就發生回漩現象，回漩後呈現出紫色。寒性尿液的顏色呈現出淡藍色，尿液稀，蒸汽和臭味也較小，泡沫大，浮膜薄，沈澱物少，在尿液冷卻、蒸汽消失以後才發生回漩，回漩後顏色發青。
當患者病情嚴重，將要死亡時，尿液中將顯現出各種死兆。尿色血紅且散發出惡臭味，經治療也無改變的，是熱性病的死兆；尿色淡青且無蒸汽、臭味、泡沫，經治療無效的，是寒性病的死兆；尿液不穩定，顏色藍黑，並且清濁分離的，是隆病的死兆；尿液的顏色有如亞大黃汁的，是赤巴病的死兆；尿液好像腐敗的乳汁的，是培根病的死兆；尿液的顏色像銀朱一樣的，是血病的死兆；尿液的顏色黑如墨汁，且清濁分離的，是中毒症的死兆；尿液逆返入體內，腎臟疾病又表現不出的，是身體內腐症的死兆。
藏醫還認為，有些疾病可能是鬼邪作祟造成的，藉著尿診打卦可以對致病的各種鬼邪一探究竟。其方法是將患者的尿液盛入驗尿的容器中，然後在容器口上用四條線段將尿液表面劃分為九個方格，彷彿一隻仰臥的烏龜，頭指的方向為正南方，右邊的三個方格分別為神域、人域、鬼域，左邊的三個方格分別為墓地、房地、田地，中間的三個方格分別為父親及祖父的地域、自己的地域、子孫的地域。醫生攪動尿液，觀察尿液在這九個部位的變化。如果在神域裡出現猶如魚眼狀的泡沫，則需要敬奉自己的護法神以祛除疾病；如果在人域裡出現魚眼狀的泡沫，則是男鬼女鬼在作祟；如果在鬼域裡出現魚眼狀的泡沫，則是世間的眾鬼作祟；如果在父親和祖父的地域裡出現魚眼狀的泡沫，則是親屬的死魂在作祟；如果在自己的地域裡出現魚眼狀的泡沫，乃是朋友的死魂作祟；如果在子孫的地域裡出現魚眼狀的泡沫，乃是姨舅鬼在作祟；如果在墓地、房地和田地裡出現魚眼狀泡沫，則是鬼魔作祟。
尿診主要被用來診斷腑器的疾病，並且在辨別寒性、熱性疾病方面最為有效。
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